Naše příspěvková organizace byla zřízena v roce 2003 jako nejvhodnější forma pro zajištění a koordinaci zastoupení Jihomoravského kraje ve vybraných zahraničních regionech, se kterými Jihomoravský kraj spolupracuje. Tento účel má naplňovat brněnská kancelář a především pracoviště příspěvkové organizace se sídlem v příslušných zahraničních regionech.

Prvním partnerským regionem Kanceláře Jihomoravského kraje pro meziregionální spolupráci byl Šumadijský okruh Srbské republiky. Činnost naší příspěvkové organizace v oblasti centrálního Srbska je datována od roku 2003. V novodobé historii jsou všechny aktivity cíleny zejména na oblast vzdělávání a kultury. 

Kancelář Jihomoravského kraje pro meziregionální spolupráci má v současnosti jedno pracoviště sídlící v zahraničí. Od 1. září 2007 zahájilo svoji činnost v belgickém Bruselu zahraniční pracoviště Zastoupení Jihomoravského kraje při Evropské unii.

Aktivity naší příspěvkové organizace byly v rámci prohloubení spolupráce Jihomoravského kraje a Zadarské župy v roce 2011 rozšířeny i do Chorvatské republiky.

Brněnská kancelář tvoří administrativní a ekonomické zázemí organizace. Právě z Brna jsou koordinovány a organizovány různorodé vzdělávací a kulturní projekty, které jsou zaměřeny jak na česko-srbskou spolupráci, výuku českého jazyka, tak na podporu Ukrajiny.

V souvislosti s realizací těchto projektů úzce spolupracujeme se ZŠ Sloup, SŠEE v Sokolnicích, DDM v Kyjově a školským zařízením pro environmentální vzdělávání Lipkou.